V Česku je mezinárodně sledovaná varianta omikronu zvaná bythos

Vybrané vzorky od pozitivně testovaných vyšetřuje celogenomovou sekvenací Národní referenční laboratoř SZÚ a některé další testující laboratoře. Sekvenace umožňuje přečíst genom konkrétní varianty viru.

"V současnosti sledované mutace ve spike již slouží pouze k potvrzení cirkulace omikronu a nelze usuzovat na přítomnost subvarianty, malý počet zaslaných testů snižuje již tak chabou výpovědní hodnotu," uvedl ve zprávě SZÚ.

Pokud vědci objeví novou variantu koronaviru, zařadí ji mezi takzvaně sledované. Nyní jsou mezi nimi kromě typu XBB.1.5 označovaného kraken také XBF nazývaná bythos a CH.1.1 orthrus. Kraken je dominantní v USA, bythos v Austrálii a orthrus na Novém Zélandu.

"S postupujícím šířením XBB.1.5 se snižuje rychlost šíření této varianty. Tento trend kopíruje dříve pozorovaný útlum v šíření BQ.1 a BQ.1.1. Pro tento jev zatím neexistuje vysvětlení," doplnili odborníci ze SZÚ. Varianty BQ.1 a 1.1 jsou subvarianty omikronu BA.5.

Od začátku epidemie bylo sekvenací vyšetřeno v ČR přes 56.500 vzorků. Za poslední dva měsíce 498. Největší podíl mezi nimi tvořila varianta BA.5, a to ve 23 procentech vzorků, a její subvarianty BQ.1 v 19 procentech a BF.7.x v 17 procentech vzorků.

Evropské centrum pro prevenci a kontrolu nemocí (ECDC) doporučuje testování všech cestujících z Číny, které mají příznaky covidu-19. K zasílání pozitivních vzorků vyzvala i národní referenční laboratoř SZÚ. Dosud byly vyšetřeny dva případy, prokázaly se v nich varianty BF.7 a BA.5.2.1, což odpovídá situaci v Číně.